了さん、こんにちは。
今回、色々と2.1.7で機能強化していただき、ありがとうございます！

一点だけ、2.1.6以前と比較して、他のサイトでも同じ形で表示が変わっている部分があり、書かせていただきました！
（他ブログのURLについては、出していいかどうかがわからないため、控えさせていただきます）

カスタマイザー＞ヘッダー＞検索ボタン設定＞検索ボタンの表示位置（PC）を「ヘッダーメニューに表示」にしたときに、一例として私の以下のブログのように、ヘッダーナビ付近のだいぶ上の部分ににずれてしまうようです。
https://tecchan.jp/
念の為、何もプラグインやデザイン変更などを行っていない素のSWELLを入れた状態のWordPressをLocalで作成しましたが、やはり同じ形でずれました。
これが不具合なのか、仕様変更によるものなのかが判断できないのですが、大変お手数ですが、お手すきの際にでも、ご確認いただけますと幸いです。